More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1865 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
105 aa  201  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  60.82 
 
 
109 aa  117  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  61.62 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  55.32 
 
 
120 aa  99.4  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  52.04 
 
 
142 aa  97.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  57.61 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  52.04 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  48.91 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
117 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  39.05 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0900  putative regulatory protein  42.27 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3353  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  29.9 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  35.56 
 
 
105 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
121 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  29.17 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6292  transcriptional regulator, ArsR family  47.87 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  31.18 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  29.17 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0828  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196547  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  49.21 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  43.86 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  41.11 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  32.63 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  35.05 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 
120 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  35.24 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  29.07 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.12 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0485  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  37.5 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 
330 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  47.54 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
103 aa  52.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  47.54 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.85 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  47.54 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>