More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0828 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0828  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 113 aa  221  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196547  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  63.11 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  61 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  52 
 
 		 111 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0900  putative regulatory protein  52 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3353  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1838  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  41.41 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  35.79 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 250 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  40.21 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  35.51 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  33.96 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2391  regulatory protein ArsR  39.6 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  38.38 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  32.29 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0485  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  42.47 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  42.47 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 104 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.25 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  34.09 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  38.3 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0479  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741609  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6292  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  37.14 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3553  regulatory protein, ArsR  39 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 257 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  40 
 
 		 266 aa  52.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 330 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  38.95 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 263 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 250 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 250 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>