More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2391 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2391  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 115 aa  232  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  75 
 
 		 104 aa  153  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  74 
 
 		 104 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  74 
 
 		 107 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  71 
 
 		 110 aa  150  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  64.36 
 
 		 263 aa  134  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  62.75 
 
 		 268 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  58.82 
 
 		 104 aa  130  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  60 
 
 		 111 aa  123  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  60 
 
 		 111 aa  123  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 257 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  54.9 
 
 		 263 aa  107  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  59.77 
 
 		 250 aa  105  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  59.77 
 
 		 250 aa  105  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  59.77 
 
 		 250 aa  105  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 247 aa  104  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  52 
 
 		 250 aa  103  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  49 
 
 		 268 aa  103  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  54.55 
 
 		 267 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  51.96 
 
 		 270 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0745  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.43 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.371363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  49.04 
 
 		 260 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1940  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146779  normal  0.0107973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 102 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 97 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3179  transcriptional regulator, ArsR family  50.59 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000156262  hitchhiker  0.00000576379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  45.24 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  51.16 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2619  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276362  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3410  regulatory protein, ArsR  48.78 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.625513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0690  regulatory protein ArsR  42.72 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  48.24 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3231  transcriptional regulator, ArsR family  43.12 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942122  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3526  transcriptional regulator, ArsR family  43.12 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0231153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3302  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4518  regulatory protein, ArsR  40.59 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0897151  normal  0.876093 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.86 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1482  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.415166  normal  0.401747 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  38.24 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  35.24 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  35.79 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  41.98 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  32.08 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0457  ArsR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  45.71 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  45.71 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  31.78 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  40.22 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>