More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1475 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  89.42 
 
 		 107 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  81.73 
 
 		 104 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  77.23 
 
 		 110 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2391  regulatory protein ArsR  74 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  65.05 
 
 		 111 aa  137  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  65.05 
 
 		 111 aa  137  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  63.64 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  64 
 
 		 263 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  63 
 
 		 268 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  57 
 
 		 268 aa  123  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 250 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 250 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 250 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  55 
 
 		 247 aa  110  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  55.45 
 
 		 250 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 257 aa  107  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  57 
 
 		 263 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  53.77 
 
 		 270 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  52.48 
 
 		 267 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0745  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.92 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.371363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  47.62 
 
 		 260 aa  90.9  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  52.33 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 102 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  49.43 
 
 		 97 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2619  transcriptional regulator, ArsR family  48.35 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1940  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146779  normal  0.0107973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3179  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000156262  hitchhiker  0.00000576379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3410  regulatory protein, ArsR  46.43 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.625513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0690  regulatory protein ArsR  42 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.55 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3231  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942122  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3302  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4518  regulatory protein, ArsR  39.81 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0897151  normal  0.876093 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  44.71 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3526  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0231153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  38.61 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  46.58 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.29 
 
 		 240 aa  61.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  41 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  35.92 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  38.83 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  33.96 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  37.62 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  34.94 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  35 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1482  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.415166  normal  0.401747 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.35 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  34.58 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  30.77 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>