More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11930 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 105 aa  204  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  54.84 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.52 
 
 		 193 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  49.44 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  53.76 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  52.22 
 
 		 99 aa  94.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  44.76 
 
 		 124 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  43.69 
 
 		 110 aa  90.1  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  51.72 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  50.53 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  43.62 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  45.92 
 
 		 112 aa  80.1  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  44.66 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  44.76 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  45.28 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  45.56 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  39.22 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5809  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522753  normal  0.488777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  41.94 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  49.4 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  41.28 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2669  regulatory protein ArsR  47.44 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311872  normal  0.215789 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2578  regulatory protein ArsR  43.43 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3678  transcriptional regulator ArsR family  46.15 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  38.83 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  39.42 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  30.61 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  39.62 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  30.3 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.05 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  38.38 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  49.35 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  35.64 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  43.52 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>