More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3410 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3410  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 129 aa  266  7e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.625513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  67.03 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  64.21 
 
 		 104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  64.21 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  70.45 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2619  transcriptional regulator, ArsR family  70.93 
 
 		 101 aa  127  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  68.24 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  65.88 
 
 		 106 aa  124  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3179  transcriptional regulator, ArsR family  57.45 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000156262  hitchhiker  0.00000576379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  47.67 
 
 		 263 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  53.01 
 
 		 268 aa  87  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  47.67 
 
 		 268 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 250 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 250 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 250 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  47.13 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2391  regulatory protein ArsR  48.78 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1940  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.6 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146779  normal  0.0107973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  48.19 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  48.19 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  45.24 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 263 aa  80.1  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 267 aa  78.2  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0745  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.371363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  43.33 
 
 		 260 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  43.96 
 
 		 270 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1482  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.415166  normal  0.401747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  40.45 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0690  regulatory protein ArsR  37.78 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 107 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  40.66 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.24 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  37.8 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3545  regulatory protein ArsR  39.24 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.927906  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3231  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942122  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  35.8 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  35.92 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3302  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8346  hypothetical protein  75 
 
 		 48 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3526  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0231153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  37.78 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 90 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 103 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 105 aa  50.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  32.93 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  35.78 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  37.78 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  34.15 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  36.08 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  37.65 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  33.33 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2669  regulatory protein ArsR  36.59 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311872  normal  0.215789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>