287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0745 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0745  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
119 aa  239  7e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.371363  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  63.46 
 
 
250 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  61.11 
 
 
267 aa  131  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  61.9 
 
 
260 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  59.05 
 
 
257 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
247 aa  116  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  53.1 
 
 
263 aa  110  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  55.24 
 
 
270 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  52.43 
 
 
268 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  50.48 
 
 
111 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  50.48 
 
 
111 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2391  regulatory protein ArsR  52.43 
 
 
115 aa  97.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  51.92 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  51.92 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  50.48 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  51.43 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  44.76 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0690  regulatory protein ArsR  47.66 
 
 
110 aa  93.2  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  52.43 
 
 
263 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  51.46 
 
 
268 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  56.32 
 
 
250 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  56.32 
 
 
250 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  56.32 
 
 
250 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3231  transcriptional regulator, ArsR family  47.17 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942122  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  47.06 
 
 
97 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  47.62 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3526  transcriptional regulator, ArsR family  44.95 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0231153  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.66 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3179  transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000156262  hitchhiker  0.00000576379 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3302  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3410  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.625513  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2619  transcriptional regulator, ArsR family  47.78 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276362  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4518  regulatory protein, ArsR  37.74 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0897151  normal  0.876093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1940  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146779  normal  0.0107973 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0457  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  38.83 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  38.83 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  38.83 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  38.83 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  39.25 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1482  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.415166  normal  0.401747 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
193 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
107 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  38.83 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  33.96 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.37 
 
 
240 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  45.78 
 
 
109 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
104 aa  53.9  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  39.42 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  43.68 
 
 
169 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  41.38 
 
 
123 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 
94 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  41.56 
 
 
111 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  30.39 
 
 
108 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
108 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  35.45 
 
 
113 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  35.19 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
197 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  34.31 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  32.41 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>