More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS04778 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 111 aa  224  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 111 aa  224  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  67.96 
 
 		 104 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  65.05 
 
 		 104 aa  140  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  65.05 
 
 		 104 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  64.08 
 
 		 107 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  63.11 
 
 		 110 aa  134  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  57.84 
 
 		 268 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2391  regulatory protein ArsR  60 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  60.4 
 
 		 267 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 247 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  55 
 
 		 250 aa  114  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 257 aa  113  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  54.46 
 
 		 263 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  53.47 
 
 		 268 aa  111  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  52.88 
 
 		 270 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  53.47 
 
 		 263 aa  107  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0745  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.48 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.371363  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 250 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 250 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 250 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  47.62 
 
 		 260 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  55.17 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3179  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000156262  hitchhiker  0.00000576379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2619  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  47.06 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3410  regulatory protein, ArsR  48.19 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.625513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3231  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942122  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3526  transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0231153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0690  regulatory protein ArsR  42.57 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4518  regulatory protein, ArsR  43.69 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0897151  normal  0.876093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3302  transcriptional regulator, ArsR family  41.51 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1940  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146779  normal  0.0107973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  36 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39 
 
 		 288 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0457  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  38.64 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  39.05 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.9 
 
 		 240 aa  60.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  39.76 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  34.38 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 119 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>