More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3981 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  100 
 
 		 107 aa  217  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  89.42 
 
 		 104 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  81.73 
 
 		 104 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  79.21 
 
 		 110 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2391  regulatory protein ArsR  74 
 
 		 115 aa  151  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  64.08 
 
 		 111 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  64.08 
 
 		 111 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  63 
 
 		 104 aa  133  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  65 
 
 		 263 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  64 
 
 		 268 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  54 
 
 		 268 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 250 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 250 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 250 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 257 aa  110  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  55.24 
 
 		 267 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  53.47 
 
 		 250 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  53.33 
 
 		 270 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  56 
 
 		 263 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  53 
 
 		 247 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0745  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.92 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.371363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  48.57 
 
 		 260 aa  90.9  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 104 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 102 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  48.91 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  48.86 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  47.13 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3179  transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 		 98 aa  87.8  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000156262  hitchhiker  0.00000576379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2619  transcriptional regulator, ArsR family  50.59 
 
 		 101 aa  87.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1940  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146779  normal  0.0107973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3410  regulatory protein, ArsR  45.24 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.625513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  45.54 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0690  regulatory protein ArsR  42 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  43.53 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3231  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 110 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942122  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.25 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3526  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0231153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3302  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  39.05 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4518  regulatory protein, ArsR  37.86 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0897151  normal  0.876093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  34.55 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  37.62 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  40.7 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  33.96 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  39.76 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  37.38 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  37.62 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  37.21 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  38.75 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  32.41 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  38.83 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>