More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3179 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3179  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 98 aa  194  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000156262  hitchhiker  0.00000576379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  66.28 
 
 		 103 aa  123  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  67.47 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  65.52 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  66.27 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  65.52 
 
 		 102 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2619  transcriptional regulator, ArsR family  62.92 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276362  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3410  regulatory protein, ArsR  57.45 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.625513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1940  putative transcriptional regulator, ArsR family  62.35 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146779  normal  0.0107973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  50.54 
 
 		 268 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  48.94 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  51.76 
 
 		 263 aa  87  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2391  regulatory protein ArsR  50.59 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  50.59 
 
 		 268 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  45.45 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  45.45 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  46.59 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 247 aa  78.2  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  46.51 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  45.88 
 
 		 263 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0745  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.371363  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1482  ArsR family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.415166  normal  0.401747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.19 
 
 		 270 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  46.07 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.38 
 
 		 260 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.91 
 
 		 288 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0690  regulatory protein ArsR  34.74 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  39.56 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.33 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  41.77 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  41.77 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3545  regulatory protein ArsR  39.51 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.927906  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  42.5 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  43.24 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  40.7 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  40.45 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  37.89 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  39.47 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  40.51 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 120 aa  50.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3231  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942122  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  43.04 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8346  hypothetical protein  70.59 
 
 		 48 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  39.02 
 
 		 266 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6292  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4518  regulatory protein, ArsR  33.7 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0897151  normal  0.876093 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>