More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2621 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
107 aa  219  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  86.92 
 
 
107 aa  195  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  83.18 
 
 
107 aa  191  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  82.24 
 
 
107 aa  190  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  81.31 
 
 
107 aa  190  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  83.18 
 
 
111 aa  183  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  83.18 
 
 
107 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  83.18 
 
 
107 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  77.88 
 
 
108 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  83.18 
 
 
107 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  79.44 
 
 
107 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  80.37 
 
 
107 aa  176  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  79.44 
 
 
107 aa  175  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  79.44 
 
 
107 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  65.69 
 
 
106 aa  148  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  52.53 
 
 
103 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  51.49 
 
 
109 aa  105  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 
104 aa  104  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  44.66 
 
 
108 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 
103 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
104 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  43 
 
 
104 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 
111 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
115 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  41.41 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  44.94 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  33 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  40.43 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  38.83 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  42.55 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  36.27 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  46.07 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  40 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  31 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  31.58 
 
 
108 aa  67  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  30.93 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  45.74 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5737  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.303432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.71 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5359  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5449  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  39.81 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  35.35 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  41.75 
 
 
185 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3039  regulatory protein, ArsR  35.64 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175015  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>