More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3513 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 109 aa  223  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 107 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  52.48 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 107 aa  105  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  52.48 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  48.51 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  50.49 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  42.59 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  43 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3544  transcriptional regulator, ArsR family  49.33 
 
 		 90 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  35.51 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.73 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  39.25 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  31.43 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  35.51 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  37 
 
 		 185 aa  66.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  30.53 
 
 		 108 aa  66.6  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  38.64 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  42.05 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  35.51 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  33.64 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  36.08 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  30.61 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  33.64 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  34.58 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  32.58 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  29 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  32.69 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  41.56 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 112 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  31.78 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  31.58 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  29.47 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  29 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  32.18 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  29.59 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  42.67 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  36.17 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  35.58 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  29 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>