More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3544 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3544  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 90 aa  183  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  58.02 
 
 		 115 aa  100  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  57.5 
 
 		 115 aa  98.2  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  46.91 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  39.51 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  41.33 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  49.33 
 
 		 109 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.56 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  50.68 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  42.68 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  49.25 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 114 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  41.25 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  38.75 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  41.25 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  43.21 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  44.16 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 115 aa  62  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  39.76 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  40.51 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  40.74 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  40.26 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 437 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  39.74 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  42.67 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  47.54 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>