More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5249 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  220  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  57.95 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  57.95 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  57.95 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  51.76 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  57.14 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3678  transcriptional regulator ArsR family  51.25 
 
 		 86 aa  93.6  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2669  regulatory protein ArsR  49.41 
 
 		 86 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311872  normal  0.215789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3928  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.479587 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12071  ArsR-type repressor protein  57.83 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  48.98 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  36 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  43.4 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  47.31 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  47.13 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  46.25 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  49.38 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  47.44 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  44.32 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  37.38 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1541  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.66 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  42.53 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3544  transcriptional regulator, ArsR family  52.11 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  43.69 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 		 112 aa  67  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 97 aa  67  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 94 aa  66.6  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  43.9 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 437 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  38.3 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  43.37 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  43.96 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  36.56 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  40.2 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  40.48 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5809  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522753  normal  0.488777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>