More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3928 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3928  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 107 aa  212  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.479587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  53.4 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12071  ArsR-type repressor protein  55.43 
 
 		 156 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 107 aa  97.1  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3678  transcriptional regulator ArsR family  48.84 
 
 		 86 aa  87.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 86 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 86 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2669  regulatory protein ArsR  45.35 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311872  normal  0.215789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  41.51 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  40.59 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  43.33 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  35.05 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  35.62 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.71 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  36.79 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  41.84 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  42.05 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  39.33 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  32.04 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  28.97 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  29.29 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  47.06 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  50.82 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  37.17 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  30 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  36.17 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  38.2 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  40.86 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  45.9 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 330 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>