More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1372 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  216  6e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  84.4 
 
 		 122 aa  187  5e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  47.57 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  43.93 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  36.54 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  42.27 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  32.71 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  38.24 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  38.04 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  32.71 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  33.98 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 115 aa  73.6  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  46.67 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  31.73 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 173 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  31.37 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  33.94 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  41.11 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  33.96 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  37.35 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  32.08 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  32.08 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  42.31 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  39.77 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  38.82 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  35.42 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  38.82 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  39.44 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  41.03 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  41.98 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  39.74 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  37.18 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 119 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  37.18 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  39.73 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>