More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3050 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  77.36 
 
 		 106 aa  180  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  72.38 
 
 		 105 aa  172  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  67.92 
 
 		 106 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  66.67 
 
 		 108 aa  154  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  62.24 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  53.33 
 
 		 108 aa  134  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 111 aa  130  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 		 107 aa  130  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  57.14 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  56.12 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 		 107 aa  126  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  52.04 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  49.02 
 
 		 106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  43.81 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 123 aa  87.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  39.56 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  35.79 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  38.95 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  38.38 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  32.99 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 94 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  36.17 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  30.85 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  33.68 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.66 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  33.68 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  32.63 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  30.39 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  30.39 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  31.07 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  39.24 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 111 aa  67  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>