More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0967 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  222  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  65.74 
 
 		 193 aa  156  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  64.81 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 129 aa  144  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  62.96 
 
 		 112 aa  141  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  52.34 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  59.14 
 
 		 106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  53.61 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  45 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 105 aa  87.8  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  38.18 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  39.58 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  37.96 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  33.65 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  33.98 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  36.45 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  41.38 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  37.25 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 		 106 aa  67  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  34.38 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  38.95 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  30.19 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  36.89 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  35.24 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  31.73 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 115 aa  62  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  38.71 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  32.41 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  27.91 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  27.66 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  27.66 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  27.66 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  27.66 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  34.86 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  33.02 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>