More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0038 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
89 aa  184  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  69.23 
 
 
90 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  69.23 
 
 
96 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  69.23 
 
 
90 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  69.23 
 
 
90 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  67.95 
 
 
90 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  67.95 
 
 
90 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  64.56 
 
 
114 aa  114  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  61.18 
 
 
94 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  58.62 
 
 
125 aa  114  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  72.37 
 
 
97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  63.29 
 
 
85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  60.76 
 
 
103 aa  104  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  53.16 
 
 
87 aa  100  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  56.96 
 
 
99 aa  100  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  56.96 
 
 
103 aa  97.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  51.22 
 
 
91 aa  97.1  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  53.95 
 
 
93 aa  89.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  50.65 
 
 
94 aa  89  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  48.78 
 
 
86 aa  88.6  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  54.55 
 
 
100 aa  87.8  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  47.67 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 
99 aa  83.6  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
93 aa  78.2  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  43.9 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  45.83 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  42.86 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  43.42 
 
 
104 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
110 aa  72  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  49.18 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  43.53 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  37.8 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  54.1 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  54.1 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  37.65 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  47.54 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 
106 aa  67  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  38.82 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  41.57 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  38.2 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  39.47 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  40.85 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  37.33 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  39.51 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 
102 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  36.78 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  38.27 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  46.97 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>