More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1062 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 103 aa  205  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  60.4 
 
 		 103 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  58.25 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  58.25 
 
 		 106 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 121 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  58.76 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  58.06 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  47.54 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  45.83 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  36.99 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  52.54 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  43.24 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  41.33 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  62.5 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  51.52 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  45.9 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 197 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  40.74 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  45.45 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  51.85 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  34.67 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  38.82 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  45.35 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  49.18 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  49.18 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  47.3 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  40.54 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  51.72 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>