More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8614 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  74.36 
 
 		 124 aa  178  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  66 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  60.19 
 
 		 125 aa  135  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  60.75 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  54.47 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  59.68 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  55.45 
 
 		 116 aa  123  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  55.14 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  52.99 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  54.47 
 
 		 118 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  57.14 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  54.46 
 
 		 183 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  54.9 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  52.63 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  53.33 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  53.76 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  55.21 
 
 		 104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 115 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  59.04 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  55.43 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  55.43 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  55.43 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  48.25 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  51.55 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  59.49 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  46.6 
 
 		 117 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  48.39 
 
 		 336 aa  97.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  45.28 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  49 
 
 		 337 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  53.49 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  52.33 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  47.42 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  44.66 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  42.61 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  51.28 
 
 		 347 aa  91.3  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 130 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 119 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  51.28 
 
 		 349 aa  90.5  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  47.13 
 
 		 95 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 119 aa  87.4  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  43.1 
 
 		 119 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 337 aa  87  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  45.28 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  43.69 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  47.67 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  54.17 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.9 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  38.79 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0727  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  54.69 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  41.25 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  52.86 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  47.14 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  47.14 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  44.12 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  48.57 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  44.12 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  46.27 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  44.78 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  44.78 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  44.78 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  44.78 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  44.78 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  44.78 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  38 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  44.78 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>