More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4825 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 128 aa  260  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  71.54 
 
 		 130 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  76.47 
 
 		 119 aa  184  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  74.58 
 
 		 119 aa  184  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  72.88 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  72.03 
 
 		 119 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  70.73 
 
 		 135 aa  176  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  55 
 
 		 120 aa  133  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  55 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  63.87 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1433  ArsR family transcriptional regulator  74.39 
 
 		 105 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.662802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  38.79 
 
 		 125 aa  86.7  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  42.73 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.88 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  39.45 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  38.79 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  39.42 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 131 aa  70.1  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 349 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  40.59 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 347 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  40 
 
 		 336 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.14 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  44.58 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  40.45 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  41.77 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  39.58 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 337 aa  62  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  36.04 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  31.86 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  37.21 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 337 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  35.34 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  33.75 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  47.69 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0052  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.135929  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  35.9 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  35.87 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 223 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  42.19 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  36.78 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>