More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2999 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
130 aa  263  8e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
119 aa  236  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  98.32 
 
 
119 aa  233  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  81.54 
 
 
135 aa  214  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  71.54 
 
 
128 aa  186  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  76.27 
 
 
119 aa  184  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  66.95 
 
 
119 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  63.33 
 
 
120 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  62.5 
 
 
120 aa  148  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  70.59 
 
 
117 aa  141  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1433  ArsR family transcriptional regulator  70.73 
 
 
105 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.662802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  49.14 
 
 
125 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 
116 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  44.86 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.12 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
123 aa  90.5  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  47.47 
 
 
126 aa  90.5  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
116 aa  89  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  46.6 
 
 
119 aa  84  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  43.4 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  45.19 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  48.31 
 
 
183 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
116 aa  76.6  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  42.2 
 
 
124 aa  76.6  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  44.55 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  44.33 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  40.87 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  45.95 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 
120 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
119 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  44.3 
 
 
347 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
337 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
337 aa  65.5  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  33.61 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  50.75 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  46.27 
 
 
118 aa  58.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  32.38 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
103 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1004  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
341 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000308504  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
317 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  42.65 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 
116 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0052  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.135929  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  41.54 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
115 aa  53.5  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  35.42 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
100 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  35.14 
 
 
266 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
118 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
96 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>