More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3471 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
135 aa  273  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  81.54 
 
 
130 aa  214  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  84.87 
 
 
119 aa  201  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  84.87 
 
 
119 aa  201  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  78.81 
 
 
119 aa  186  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  70.73 
 
 
128 aa  176  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  69.49 
 
 
119 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  62.5 
 
 
120 aa  148  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  61.67 
 
 
120 aa  147  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  68.64 
 
 
117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1433  ArsR family transcriptional regulator  68.29 
 
 
105 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.662802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 
123 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 
116 aa  87.8  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
123 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  43.14 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  39.17 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  44.95 
 
 
124 aa  77  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  41.35 
 
 
123 aa  72  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
119 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 
127 aa  70.1  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  44.33 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 
116 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
125 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  40.91 
 
 
336 aa  67  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 
131 aa  66.6  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
125 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
125 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  47.44 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 
337 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 
337 aa  63.5  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  34.51 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  37.82 
 
 
174 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
347 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
349 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  37.5 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  32.84 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  32.84 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  35.63 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  41.46 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
118 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  41.89 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1291  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
122 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
270 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 
141 aa  53.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 
115 aa  53.9  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
120 aa  53.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  37.84 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 
111 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  42.19 
 
 
106 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 
120 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  37.33 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 
118 aa  52.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  46.88 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>