More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18440 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 108 aa  214  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  73.81 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  70.73 
 
 		 131 aa  123  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  70.59 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  67.06 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  65.43 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  70.67 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  74.65 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  68.29 
 
 		 116 aa  113  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  65.06 
 
 		 136 aa  110  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  58.75 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  64.63 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  62.03 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  53.61 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  59.77 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  63.41 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  55.43 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  60.98 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  59.76 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  55.81 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.29 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  57.32 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  56.47 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.7 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.7 
 
 		 115 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  58.75 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  60.81 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  55.17 
 
 		 95 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 127 aa  97.1  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  55.06 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  55.42 
 
 		 183 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  57.5 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  55.42 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  54.76 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  57.69 
 
 		 109 aa  93.2  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  51.16 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  61.11 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  52.44 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  57.14 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  48.28 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 68 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  54.17 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  47.56 
 
 		 336 aa  81.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 347 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 		 337 aa  77.4  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 349 aa  77.4  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 337 aa  73.9  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  54.41 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  40.79 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  40.79 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  40.79 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  40.79 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  40.79 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  40.79 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  55.22 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  40.79 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  39.47 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  40.79 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.47 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  50 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  37.78 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  46.25 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  44.16 
 
 		 340 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.22 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  39.13 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  39.13 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 327 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  50 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  40.85 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  40 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  39.44 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 342 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  46.51 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>