More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0711 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 68 aa  140  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  83.08 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  81.25 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  74.24 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  71.21 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  69.23 
 
 		 124 aa  103  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  70.77 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  69.7 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  66.18 
 
 		 125 aa  97.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  67.19 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  70.18 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  70.37 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  68.33 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  74 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  64.29 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  61.19 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  72.92 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  62.9 
 
 		 116 aa  84  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  70 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  69.23 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  60 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  55.38 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  52.31 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  56.67 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  52.46 
 
 		 183 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  56.67 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  55 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.77 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  52.46 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  51.67 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  46.88 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  54.84 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 347 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  57.45 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  65.91 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  51.67 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  46.77 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  53.45 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  52.54 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5044  ArsR family transcriptional regulator  61.22 
 
 		 56 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18118 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  54.55 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  55.17 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  48.33 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  51.85 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  53.7 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  51.72 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  53.49 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  53.49 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  53.49 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  53.49 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  53.49 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  53.49 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  53.49 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  51.16 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  60.87 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 339 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  53.49 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  50.94 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  49.02 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  54.35 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  45 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  50.94 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  52.27 
 
 		 342 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.46 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  52.27 
 
 		 349 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  52.27 
 
 		 354 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  52.08 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  48.28 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0315  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  44.07 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>