More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0438 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  217  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  91.09 
 
 		 120 aa  191  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  72.12 
 
 		 104 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  60.82 
 
 		 102 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  65.56 
 
 		 110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  50.96 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  50.5 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  44 
 
 		 113 aa  90.5  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  41.76 
 
 		 94 aa  84.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  41.76 
 
 		 94 aa  83.6  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  48.61 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  41.05 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  49.3 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  45.21 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  47.89 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  51.56 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  40.66 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  44.74 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  41.18 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  37.37 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  46.51 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  40.24 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.25 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.25 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0666  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  38.89 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  37.66 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  41.54 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  40.85 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  35.8 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  34.09 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 354 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  38.96 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  38.96 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  37.65 
 
 		 349 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  38.96 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 339 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 342 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.31 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  38.96 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  38.67 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.25 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  38.67 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>