More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0666 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0666  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 105 aa  213  8e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  58.82 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1527  regulatory protein ArsR  49.5 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0617879  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0315  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1545  arsenical resistance operon repressor  71.93 
 
 		 59 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  38.54 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  40.51 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  35.19 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  36.9 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  41.89 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  41.89 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  41.89 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  35.23 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  33.75 
 
 		 89 aa  67  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  43.04 
 
 		 306 aa  67  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  33.71 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  33.33 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  34.21 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 354 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  36.56 
 
 		 349 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  37.18 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  32 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  36 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  36.99 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  36 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  36.99 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  28.89 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  29.9 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  36.99 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  36.99 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 		 305 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  36.99 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  36.99 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 317 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 309 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 183 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 328 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  39.19 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 258 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  41.43 
 
 		 341 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  33.77 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 327 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  30.67 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  35.06 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>