More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1154 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
113 aa  230  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  56.25 
 
 
113 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  52.25 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  49.12 
 
 
112 aa  110  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 
112 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  53.04 
 
 
112 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0522  ArsR family transcriptional regulator  55.36 
 
 
113 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2952  ArsR family transcriptional regulator  54.46 
 
 
113 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  59.15 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
148 aa  84  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  53.95 
 
 
114 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  53.95 
 
 
114 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  53.95 
 
 
114 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  53.95 
 
 
114 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1845  transcriptional regulator, ArsR family  50.52 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  49 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  51.32 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0666  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  57.58 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
114 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  56.06 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.99 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  46.46 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  48 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  55.38 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
121 aa  77  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  48 
 
 
115 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  49.33 
 
 
116 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
115 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  49.3 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
115 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  48.05 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  51.39 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  48.05 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  48.05 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  53.62 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  54.55 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  54.55 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  48.05 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  48.05 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  48.05 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  50.72 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  48.05 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  49.28 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  49.28 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  52.17 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  49.28 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  50.77 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  50.72 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  50.72 
 
 
258 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.72 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  52.31 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.86 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
123 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  54.69 
 
 
317 aa  70.5  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  44.29 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  40.26 
 
 
89 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  43.27 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  47.14 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  35.19 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  49.28 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1872  ArsR family transcriptional regulator  40.18 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  50.7 
 
 
307 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  47.14 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1527  regulatory protein ArsR  42.65 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0617879  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  35.71 
 
 
248 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  43.18 
 
 
125 aa  67  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  39.71 
 
 
95 aa  67  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1502  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
128 aa  67  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000371011  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  38.54 
 
 
90 aa  66.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  44.62 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  47.83 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  34.83 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  45.71 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 
348 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>