More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4613 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
120 aa  234  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  83.19 
 
 
125 aa  192  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  83.19 
 
 
125 aa  189  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  66.38 
 
 
124 aa  159  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  61.54 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  55.05 
 
 
136 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
132 aa  120  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  55.34 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  54.29 
 
 
137 aa  114  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  57.29 
 
 
129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  51.33 
 
 
125 aa  110  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 
116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  52.48 
 
 
124 aa  107  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  55.68 
 
 
116 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  65.75 
 
 
95 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  55.88 
 
 
124 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  50.52 
 
 
118 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  52.88 
 
 
127 aa  103  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
123 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  46.53 
 
 
127 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  53.93 
 
 
121 aa  101  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  52 
 
 
127 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  51.04 
 
 
127 aa  100  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  48.42 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
125 aa  98.6  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  55.1 
 
 
108 aa  99  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 
123 aa  98.6  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 
125 aa  97.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  44.55 
 
 
123 aa  97.1  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 
112 aa  97.1  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 
113 aa  95.9  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  52.13 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.87 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  51.02 
 
 
119 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  52.44 
 
 
183 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
126 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  48.78 
 
 
336 aa  89.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  51.9 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  49.43 
 
 
109 aa  89  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  47 
 
 
126 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
120 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 
104 aa  88.2  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.67 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  49.37 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  48.1 
 
 
347 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
337 aa  82  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  48.1 
 
 
349 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 
337 aa  80.1  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 
116 aa  80.1  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  45.65 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 
68 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  41.58 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  47.56 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  40.95 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  47.56 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  50 
 
 
341 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
328 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  40.59 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  49.41 
 
 
349 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  49.41 
 
 
354 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  49.41 
 
 
342 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  55.88 
 
 
339 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  35 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  45.83 
 
 
340 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 
305 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  53.03 
 
 
306 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  53.03 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  35.05 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  35.05 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  34 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  35.05 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
317 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
317 aa  63.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  46.97 
 
 
305 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>