More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2310 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
121 aa  243  9e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  76.67 
 
 
131 aa  189  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  57.69 
 
 
119 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  46.23 
 
 
117 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  51.38 
 
 
123 aa  99  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  46.23 
 
 
127 aa  96.7  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 
119 aa  96.3  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  44.95 
 
 
125 aa  93.6  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  45.19 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  45.63 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 
116 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  42.48 
 
 
123 aa  87.4  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
125 aa  87.4  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  46.46 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  45.92 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 
113 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
116 aa  82  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
104 aa  80.1  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  48.65 
 
 
183 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  41.24 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  54.79 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  39.45 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  44.83 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.56 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  37.96 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  39.29 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  37.76 
 
 
336 aa  72  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  53.03 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  42.05 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  39 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  37.17 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  39 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
136 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  45.21 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
105 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
115 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  37.5 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  37.5 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.3 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  35.21 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  35.19 
 
 
337 aa  65.1  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  35.06 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0666  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  31.87 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  44.59 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 
347 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
90 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  30.77 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  46.03 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  47.14 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  36.62 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
114 aa  62  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  47.69 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
103 aa  61.6  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>