More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0419 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 117 aa  231  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  51.9 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  49.37 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 109 aa  87.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  38 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  48.78 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  38.24 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  38.24 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  49.33 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  38.24 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  38.38 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  34.74 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  39.58 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  43.82 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  45.57 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  38.54 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  37.89 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  40.24 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  40.7 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  36.9 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4498  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  48.57 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  38.67 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  40.62 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  40.51 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  38.57 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3556  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.859788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0073  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.77483 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  31.68 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  34.94 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>