More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1115 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 113 aa  236  8e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  69.91 
 
 		 113 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  67.92 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  64.36 
 
 		 111 aa  150  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  65 
 
 		 111 aa  147  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 111 aa  147  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  65 
 
 		 111 aa  142  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 109 aa  94.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  47.67 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 109 aa  92.8  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  51.16 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  48.19 
 
 		 97 aa  86.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  48.19 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  39.78 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  41.24 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  39.78 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  37.38 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  39.13 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  37.38 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  40.22 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  40.96 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  41.41 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  37.76 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1838  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  35.23 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  37.14 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  37.8 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.73 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  33.77 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  33.73 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  34.18 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  32.53 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  41.54 
 
 		 336 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.21 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  37.84 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  33.78 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8615  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00863901  normal  0.187471 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  27.84 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  35.82 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  42.59 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  35.82 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2393  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0242789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2201  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00183018  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  31.33 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  31.33 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  31.33 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>