More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2833 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 97 aa  196  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  81.32 
 
 		 107 aa  153  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  70.97 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  68.82 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  68.82 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  61.63 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  62.16 
 
 		 109 aa  103  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  51.04 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  54.43 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  56.82 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  60.27 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  55.68 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  60.27 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  60.27 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  56.82 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  45.74 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  53.52 
 
 		 109 aa  93.6  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  49.44 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  48.19 
 
 		 113 aa  86.7  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  51.32 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  45.78 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  54.41 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  48.28 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  48.75 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  45.21 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  53.45 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  50.77 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  39.29 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  43.28 
 
 		 164 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  37.14 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  37.33 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  42.53 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5706  hypothetical protein  39.74 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.23 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  35.23 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  41.89 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2453  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  44.59 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 117 aa  52  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0502  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  34.67 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  39.73 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>