More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0554 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  100 
 
 
114 aa  235  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  54.95 
 
 
116 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  43.62 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  44.68 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  44.68 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  48.86 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  40.34 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  41.75 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
111 aa  67  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  35.71 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 
113 aa  62.8  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
103 aa  63.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
113 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  53.45 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  40.51 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
117 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  34.48 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  50.82 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
121 aa  57.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 
109 aa  57  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  37.08 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  36.11 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  36.11 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  36.84 
 
 
94 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 
95 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  38.46 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
90 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  36.84 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  44.78 
 
 
105 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  30.85 
 
 
105 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
125 aa  52.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  37.37 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 
103 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  38.04 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
108 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
101 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  39.19 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
270 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0706  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  43.06 
 
 
123 aa  50.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1707  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
119 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000753333  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  49.09 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  38.75 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  30.99 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  35.37 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  40.85 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  35.05 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  43.24 
 
 
183 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  43.1 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1719  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
317 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2099  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
110 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321507  normal  0.577048 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  36.76 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  36.14 
 
 
270 aa  48.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>