More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0850 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 109 aa  224  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  98.17 
 
 		 109 aa  221  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  97.25 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  80.2 
 
 		 109 aa  172  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  60.91 
 
 		 110 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  58.33 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  59.63 
 
 		 109 aa  133  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  55.1 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  51.38 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  54.08 
 
 		 138 aa  114  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  52.94 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  56.18 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  57.3 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  59.04 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  60.27 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  57.33 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 		 113 aa  90.5  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 111 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 111 aa  88.2  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  45.98 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  41.94 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  45.78 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  51.56 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  41.03 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  45.83 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0051  transcriptional repressor  38.04 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  41.89 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  44.3 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  27.18 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  45.16 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  41.79 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  31.63 
 
 		 95 aa  52.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  38.37 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  44.07 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  35.96 
 
 		 98 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1906  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 472 aa  50.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5478  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.350529  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1433  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.662802 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  38.36 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  44.83 
 
 		 95 aa  48.1  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 		 306 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  36.47 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  34.18 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3227  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3201  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00511684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3450  regulatory protein ArsR  32.91 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3457  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2171  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0439276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3439  ArsR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>