More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0925 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
143 aa  288  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  34.04 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
110 aa  70.1  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
111 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  34.48 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  30.53 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
111 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3740  ArsR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  27.18 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  27.18 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  27.18 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  31.68 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  30.56 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  34.78 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  27.47 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2994  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
105 aa  52  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
119 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
368 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  37.84 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
368 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  39.68 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5389  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1433  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.662802 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
107 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
87 aa  50.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  27.71 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  44.44 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  37.84 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  28.75 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  41.79 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  28.75 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
103 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  27.16 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  27.5 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0052  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.135929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  27.96 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  27.5 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  28.75 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
197 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  28.75 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
101 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 
115 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  36.25 
 
 
119 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 
100 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 
106 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
104 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
122 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
125 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>