More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1262 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 133 aa  256  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  75 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  71.29 
 
 		 120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  71.29 
 
 		 120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  71.29 
 
 		 120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  72.9 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  65.25 
 
 		 131 aa  137  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  71.13 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  66.67 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  68.89 
 
 		 103 aa  127  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  62.77 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 		 84 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  37.86 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  39.76 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  43.01 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  37.63 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  32.41 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  36.56 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  38.64 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  34.65 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  40.96 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  41.89 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  34.41 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 100 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  45.95 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  39.44 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  31.18 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  49.21 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  37.63 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  40.54 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  35.23 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  46.05 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  46.27 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  46.27 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  43.04 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  36.73 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  30.48 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  32.14 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  43.66 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>