More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5389 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5389  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 111 aa  222  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2282  transcriptional regulator, ArsR family  85.32 
 
 		 113 aa  175  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4716  transcriptional regulator, ArsR family  67.33 
 
 		 123 aa  124  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  44.71 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 109 aa  57  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  41.77 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  37.84 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  36.67 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  36.67 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  36.67 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  36.67 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8615  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00863901  normal  0.187471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 355 aa  52  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  37.36 
 
 		 227 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  38.96 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  36.47 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1931  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0246294  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  34.44 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03940  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.621476  normal  0.0987714 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2783  ArsR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 346 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.242907  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 227 aa  50.8  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3026  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 347 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.775949  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 254 aa  50.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2985  transcriptional regulator, ArsR family  42.37 
 
 		 347 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000023297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 227 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  41.27 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  36.71 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2778  ArsR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 347 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2727  ArsR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 347 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0462695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2990  transcriptional regulator, ArsR family  42.37 
 
 		 347 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2989  ArsR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 347 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  34.69 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  33.66 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2254  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 347 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.205075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>