265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03940 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03940  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 98 aa  197  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.621476  normal  0.0987714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2283  regulatory protein, ArsR  58.82 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4059  regulatory protein, ArsR  58.33 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.507544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2062  ArsR family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242619  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2108  ArsR family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777393  normal  0.0654079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1972  transcriptional regulator, ArsR family  56.82 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845945  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2045  ArsR family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1926  regulatory protein ArsR  54.76 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04390  predicted transcriptional regulator  44.09 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5180  transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3539  MarR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.107907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  39.78 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  41.03 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 102 aa  52  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  36.47 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  36.47 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 227 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2225  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.666474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  30.26 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  32.14 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  30.26 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  44.59 
 
 		 111 aa  50.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5389  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  32.91 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  33.33 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  30.23 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  39.76 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  34.72 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  28.57 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0687  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  40.66 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  38.16 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 297 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  36.9 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  28.26 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0451  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  36.99 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  37.21 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  42.03 
 
 		 118 aa  47.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  38.16 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 305 aa  46.2  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  31.94 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  29.67 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  38.82 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  38.55 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  37.7 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  32.79 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  24.73 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  38.57 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  39.44 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 318 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  39.06 
 
 		 285 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>