184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04390 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04390  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 132 aa  256  8e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2283  regulatory protein, ArsR  50.48 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4059  regulatory protein, ArsR  48.57 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.507544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2062  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242619  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2108  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777393  normal  0.0654079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2045  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03940  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.621476  normal  0.0987714 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1926  regulatory protein ArsR  45.98 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5180  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1972  transcriptional regulator, ArsR family  46.25 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845945  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  37.93 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3539  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.107907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  44.05 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  29.52 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  32.99 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  33.06 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  28.43 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  28.07 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  28.07 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  29.41 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2275  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  30.51 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0451  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  41.1 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0116  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  28.12 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.43 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  28.43 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  28.43 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  39.73 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  43.84 
 
 		 168 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  31.67 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  28.74 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  40.24 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  30.86 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  30.39 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  33.72 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  42.67 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 123 aa  43.5  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  30.14 
 
 		 97 aa  43.5  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  26.47 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  33.73 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0903  putative transcriptional regulator, PaaX family  39.62 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2896  regulatory protein ArsR  46.67 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>