243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1972 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1972  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 102 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845945  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03940  transcriptional regulator, ArsR family  56.82 
 
 		 98 aa  92  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.621476  normal  0.0987714 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1926  regulatory protein ArsR  48.89 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2062  ArsR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242619  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2108  ArsR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.777393  normal  0.0654079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2045  ArsR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4059  regulatory protein, ArsR  46.51 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.507544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2283  regulatory protein, ArsR  46.51 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3539  MarR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.107907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04390  predicted transcriptional regulator  46.25 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5180  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  39.19 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  37.84 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 297 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  37.14 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3740  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  32.18 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6743  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.661837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  36.59 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  39.39 
 
 		 100 aa  50.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  38.57 
 
 		 101 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 115 aa  50.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  37.66 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  40.24 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  34.21 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  31.08 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  37.97 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  40.48 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  32.95 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  37.31 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  38.67 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  31.34 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  34.29 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  34.29 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  34.85 
 
 		 98 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  34.85 
 
 		 98 aa  47.4  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  34.85 
 
 		 98 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 98 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 98 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 98 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  34.85 
 
 		 98 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 126 aa  47.4  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 98 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  34.85 
 
 		 98 aa  47.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  37.65 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  37.8 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0451  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  33.71 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  34.25 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1714  ArsR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.515787  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  33.73 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3088  regulatory protein, ArsR  25.56 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>