271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5082 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 107 aa  205  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  83.16 
 
 		 111 aa  159  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  76.77 
 
 		 151 aa  150  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  72.64 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  71.43 
 
 		 108 aa  144  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  78.12 
 
 		 110 aa  141  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  71.72 
 
 		 168 aa  137  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  71.43 
 
 		 109 aa  135  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  74.16 
 
 		 111 aa  134  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  70.41 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  70.41 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  70.41 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  73.47 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  66.36 
 
 		 111 aa  130  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  75.51 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  60.75 
 
 		 109 aa  123  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  63.83 
 
 		 111 aa  117  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  54.29 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  54.08 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  55.21 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  53.12 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  57.14 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  60.23 
 
 		 115 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  58.06 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  40.96 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  46.58 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  44.59 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  38.1 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  45.21 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  38.1 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  35.9 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  43.55 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  43.55 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  44.59 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  42.62 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  43.24 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  43.24 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  37.84 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4723  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 228 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  41.79 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  34.94 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  29.87 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 245 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 399 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  38.36 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  38.57 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  41.03 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  43.28 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  42.03 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  34.57 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  35.62 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  33.75 
 
 		 358 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  43.33 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>