269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11840 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 119 aa  239  9e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  73.68 
 
 		 119 aa  169  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  67.24 
 
 		 119 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  70.54 
 
 		 119 aa  160  4.0000000000000004e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  69.64 
 
 		 119 aa  157  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  69.64 
 
 		 119 aa  157  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  67.92 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  63 
 
 		 111 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  60.95 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  59.79 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  58.76 
 
 		 151 aa  115  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  56.73 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  59.38 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 111 aa  115  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 117 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 117 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 117 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  54.29 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  60.67 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  56.52 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  53.06 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  55.32 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  53.93 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  52.33 
 
 		 168 aa  96.3  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  37.66 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  38.55 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  34.67 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  35.35 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  40.74 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  39.47 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  39.47 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  39.47 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  41.33 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  36.9 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  38.67 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  36.46 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  44.62 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 399 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  32.88 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  32.93 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  33.77 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  30.56 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  31.4 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 105 aa  47.4  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  30.11 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  36.14 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>