More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2439 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 134 aa  260  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  82.29 
 
 		 151 aa  157  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  75.51 
 
 		 107 aa  142  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  73.4 
 
 		 111 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  67.31 
 
 		 109 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  74.47 
 
 		 110 aa  137  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  61.68 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  58.14 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  66.67 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 117 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 117 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 117 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 111 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 113 aa  120  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  68.13 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  59.79 
 
 		 125 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  63.74 
 
 		 111 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  64.44 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  61.11 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  57.43 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  52.78 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  53.47 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  48.62 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  51.55 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  56.18 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  38.95 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  39.73 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  46.77 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  37.84 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 399 aa  55.1  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  51.56 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  46.67 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  37.36 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  50.67 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  34.74 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  40.54 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  34.94 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 222 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  48 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 143 aa  50.1  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 103 aa  50.1  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  35.21 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  39.74 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 317 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0701  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 228 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4723  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 228 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0646  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 228 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646184  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 245 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 228 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  32.91 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 		 226 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  41.27 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>