More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13776 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
135 aa  271  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4283  transcriptional regulator, ArsR family  71.67 
 
 
124 aa  153  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 
102 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 
119 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0599  TrmB/ArsR family transcriptional regulator  49.47 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0451  transcriptional regulator, ArsR family  42.2 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115679  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 
141 aa  77  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 
119 aa  77  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  40 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  39.53 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
124 aa  72  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
124 aa  72  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  34.26 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  34.26 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  39.36 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.66 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  43.33 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  45.57 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  38.26 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
122 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  37.8 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  39.58 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  38.38 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  33.68 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  33.68 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  32.41 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  39.02 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  35.96 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  36.59 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
116 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 
98 aa  62.8  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  40.51 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 
119 aa  62.8  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  40.51 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  28.7 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>