More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11220 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  100 
 
 
358 aa  716    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 
124 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
93 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
122 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  29.89 
 
 
110 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
192 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
106 aa  60.1  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
116 aa  60.1  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
120 aa  59.7  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  34.09 
 
 
125 aa  59.3  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
120 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
125 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
146 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  34.25 
 
 
102 aa  58.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 
110 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
125 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 
121 aa  57.4  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 
121 aa  57  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  30.77 
 
 
118 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
102 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  34.25 
 
 
102 aa  57  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
125 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  29.82 
 
 
124 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  34.67 
 
 
129 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 
123 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 
131 aa  56.2  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
104 aa  56.2  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  31.97 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
134 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  28.72 
 
 
183 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
125 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
125 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
111 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 
218 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 
114 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  34.94 
 
 
95 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
121 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  32.98 
 
 
138 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
107 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
125 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1936  transcriptional regulator, ArsR family  30.59 
 
 
109 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
125 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  28.72 
 
 
120 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 
120 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
115 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0682  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
97 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
119 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  31.68 
 
 
122 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  34.15 
 
 
87 aa  53.9  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 
109 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
105 aa  54.3  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
103 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  27.71 
 
 
123 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
121 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  36.11 
 
 
114 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  37.68 
 
 
94 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  29.27 
 
 
126 aa  53.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  29.59 
 
 
121 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 
119 aa  53.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
95 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  23.33 
 
 
227 aa  53.1  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  32.1 
 
 
127 aa  53.1  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  30.77 
 
 
119 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
124 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
124 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
124 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  34.15 
 
 
95 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
87 aa  52.8  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  32.05 
 
 
119 aa  53.1  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
95 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  30.12 
 
 
119 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2884  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
133 aa  52.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.301684 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
113 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
104 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
96 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
141 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 
133 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
103 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  21.04 
 
 
350 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
110 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
113 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  32.53 
 
 
118 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
103 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
117 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  32.88 
 
 
106 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 
142 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  40.62 
 
 
113 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  27.37 
 
 
127 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  44.64 
 
 
118 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  28.97 
 
 
127 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 
120 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1464  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 
97 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  29.27 
 
 
120 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 
115 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  24.18 
 
 
137 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  35.63 
 
 
119 aa  51.6  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 
121 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 
114 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>