More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0687 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  100 
 
 
95 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
95 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  98.95 
 
 
95 aa  197  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  94.74 
 
 
95 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  82.22 
 
 
95 aa  158  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  45.88 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  48.68 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  41.3 
 
 
119 aa  80.1  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  48.65 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  48.65 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  43.48 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  46.38 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  50.72 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  44.58 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  44.58 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  48.72 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  35.16 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0487  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  29.67 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  38.71 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  38.71 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
116 aa  72  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  42.17 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  42.5 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  46.97 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.97 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.97 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.97 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.97 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.97 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.97 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  46.97 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  42.05 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  34.15 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  42.05 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  43.66 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  35.42 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
117 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  40.79 
 
 
113 aa  67  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  32.14 
 
 
122 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.94 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.42 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  29.55 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  36.59 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  32.53 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  29.67 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>