More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1091 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  100 
 
 
104 aa  217  3.9999999999999997e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  59 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  63.64 
 
 
102 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  50.96 
 
 
106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  56.98 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  54.35 
 
 
105 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  49.04 
 
 
104 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  50 
 
 
94 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  50 
 
 
94 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  42.86 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  48.72 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  48.72 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  47.44 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  43.06 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  40.43 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
104 aa  70.1  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  46.48 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  42.65 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  36.54 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  36.54 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  36.54 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  36.54 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  36.54 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  36.54 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  36.54 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  34.44 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  37.89 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  36.84 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  39.29 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  33.72 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  41.98 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2324  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  38.37 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  38.37 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  36.25 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  36.71 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.02 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  36.14 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40.85 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  39.71 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 
115 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  37.66 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  36.62 
 
 
127 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0211  arsenical resistance operon repressor  37 
 
 
105 aa  62  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.04 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.04 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>