More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3114 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
110 aa  220  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  60.4 
 
 
102 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  65.56 
 
 
106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  56.48 
 
 
120 aa  123  9e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  57.58 
 
 
104 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  56.98 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  57.47 
 
 
107 aa  105  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  51.11 
 
 
105 aa  99.4  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  50 
 
 
94 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  50.6 
 
 
94 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  44.83 
 
 
113 aa  88.6  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  44.05 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 
95 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  49.25 
 
 
95 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
120 aa  71.6  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  35.87 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  36.47 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  33.64 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  41.67 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  38.96 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  35.58 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 
119 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  42.86 
 
 
101 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  42.86 
 
 
101 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  42.86 
 
 
101 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  45.59 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  44.12 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  45.59 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  45.59 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  37.68 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  35.35 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  45.59 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  45.59 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  34.15 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  39.51 
 
 
307 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  39.47 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  42.03 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 
307 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  37.88 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0487  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  40.54 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  42.42 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
106 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 
103 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 
349 aa  63.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
337 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
317 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.1 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  39.19 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
309 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>